FT-IR spektroskopie se již tradičně využívá při stanovení chemického složení hornin a minerálů. Její aplikace se pohybují od analýzy práškových vzorků až po mapování větších ploch řezů pomocí imagingové spektroskopie. Proto není divu, že je pro geologické vzorky vhodná i metoda nano-FTIR.
Mezi nejzajímavější geologické vzorky patří bezpochyby chondrule. Jedná se o kamenné meteority obsahující zrnka roztavených minerálů, které vznikly v době, kdy vznikala i naše sluneční soustava, jsou tedy velmi důležitými svědky našeho slunečního systému a mohou nám napovědět, jaké podmínky zde v době jeho vzniku panovaly.
Kromě přesného stanovení anorganických složek chondrulí je nano-FTIR užitečným nástrojem i v případě jejich organických složek. Taková zjištění jsou zásadní mimo jiné pro výzkum teorií o vzniku života na Zemi.