Pojmem bakteriální flokule se nejběžněji označují shluky (vločky) tvořené mikroorganismy. Nejčastěji jsou tyto „vločky“ využívané pro čištění odpadní vody ve formě aktivního kalu. Následující studie se zabývá novou metodou chemické flokulace: chemické činidlo přidané do bakteriální kultury Escherichia coli (E. coli) se samo uspořádá do vláknitých struktur a fyzicky propojí jednotlivé bakteriální buňky. Flokulace vyvolává tvorbu bakteriálních agregátů a je široce využívána k imobilizaci a uspořádání mikroorganismů pro následnou analýzu.

Hyperspektrální konfokální Ramanovo zobrazování provedené v přístroji IRa-SCOPE jasně detekuje charakteristické vibrační znaky E. coli i flokulačního činidla. Mapování pásu 2935 cm⁻¹, odpovídajícího vibracím lipidů a membrán, jasně zobrazuje Ramanovu mapu buněk E. coli, zatímco nitrilový pás 2228 cm⁻¹ zobrazuje distribuci flokulačního činidla koncentrujícího se v extracelulární matrici.

Korelativní analýza pomocí nano-FTIR, provedená ve stejném přístroji na stejném místě vzorku, odhaluje detailní chemickou informaci v měřítku 10 nm. Zobrazování zaznamenané v oblasti proteinového pásu Amid I (1664 cm⁻¹) přímo mapuje bakteriální buňky, zatímco vibrace C–N (1257 cm⁻¹) zvýrazňuje matrici flokulí. Nano-FTIR navíc překvapivě odhaluje intracelulární inkluzní tělíska s jasnými signaturami proteinové agregace, které nebyly pozorovány měřeními pomocí Ramanovy spektroskopie. Korelativní mapování tohoto typu vzorků pak poskytuje bezprecedentní výsledky pro další výzkum.